COVID-19 outbreak of community transmission in a municipality in Havana (March-April, 2021)

Authors

Keywords:

transmission, infection, COVID-19, outbreak, Havana.

Abstract

Introduction: A timely investigation of COVID-19 epidemiological events guarantees to minimize the spread of the disease in the population.

Objective: To characterize the COVID-19 outbreak of community transmission in a municipality in Havana.

Methods: Cross-sectional study of positive cases of SARS-CoV-2 infection of the “Cathedral” outbreak in Old Havana in 2021.  The variables analyzed were: age, sex, city block of residence, date of symptom onset, date of diagnosis, clinical manifestations, and type of case. The methodology for the study of outbreaks was used.  Percentages, differences in proportions, rates, effective reproductive number, and dispersion parameter with 95% confidence intervals were calculated.

Results: The outbreak was reported on March 23 and closed on April 22 with 106 cases (attack rate of 4.51%). The peak was notified on March 29 with 40 cases (37.73%).  The mean age was 43 years. Adults aged 60 years and older (30.18%), women (58.49%), and block 0024 (45.28% of cases) were most affected. A total of 77.3% were asymptomatic, including two superspreaders; symptomatic cases were mild and there were no deaths.  The overall effective reproductive number was 0.94 (CI: 0.70-1.21); higher in asymptomatic cases (11.43 versus 4.00); and the dispersion parameter was 0.89 (CI: 0.51-2.09), higher in symptomatic cases (1.06 versus 0.69).

Conclusions: Timely epidemiological control of each case ensured the short duration of the outbreak and no deaths.

 

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Author Biographies

Elba Cruz Rodríguez, Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí

Médico Epidemióloga investigadora del Departamento de Vigilancia e Investigaciones Epidemiologicas del Centro de Investigación, Diagnóstico y Referencia

Belkys María Galindo Santana, Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí

Especialista de I grado en medicina general integral y II grado en epidemiología, master en epidemiología, investigadora y profesora titular, doctora en ciencias médicas

Waldemar Baldoquín Rodríguez, Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí

Especialista de I grado en medicina general integral, y en bioestadística, investigador auxiliar, profesor asistente.

Niurka Molina Águila, Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí

Especialista de I grado en medicina general integral y de II grado en epidemiología, master en enfermedades infecciosas, profesora auxiliar

Dayana Rodríguez Velázquez, Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri

Licenciada en Geografía, máster, profesor instructor, aspirante a investigador

References

Castaneda C, Ramos G. Principales pandemias en la historia de la humanidad. Revista Cubana de Pediatría [Internet]. Jun 2020. [citado el 20 de Feb 2022]; 92. Disponible en: http://www.revpediatria.sld.cu/index.php/ped/article/view/1183/714

Castaneda C, Martínez R, López A. Grandes pandemias y sus desafíos. Dilemas contemp. educ. política valores [Internet]. 2021 [citado el 28 de nov 2022]; 8(3),00047. Disponible en: https://doi.org/10.46377/dilemas.v8i3.2671.

Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol [Internet]. 2021 [citado el 28 de nov 2022]; 5,536–544. Disponible en: https://doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z

Organización Mundial de la Salud. Cronología de la respuesta de la OMS a la COVID-19 [Internet]. 2020 [actualizado 29 enero 2021; citado el 28 de nov 2022]; Disponible en: https://www.who.int/es/news/item/29-06-2020-covidtimeline

Ministerio de Salud Pública, República de Cuba. Nota informativa sobre el nuevo coronavirus en Cuba [Internet]. Minsap; La Habana, 11 marzo 2020 [citado 28/11/2022]. Disponible en: https://salud.msp.gob.cu/nota-informativa-sobre-el-nuevo-coronavirus-en-cuba/

Venero S, Más M, Cuellar L, de Armas Y, Suárez R, Pérez D, et al. Características epidemiológicas de la COVID-19 en La Habana, epicentro de Cuba. Revista Cubana de Higiene y Epidemiología [Internet]. 2021 [citado 28 Nov 2022]; 58 Disponible en: http://www.revepidemiologia.sld.cu/index.php/hie/article/view/1025

Ministerio de Justicia, República de Cuba. La Habana: epicentro de la COVID-19 en Cuba [Internet]. Minjus, La Habana, 18 mayo de 2020 [citado 28 Nov 2022]. Disponible en. https://www.minjus.gob.cu/es/noticias/la-habana-epicentro-de-la-covid-19-en-cuba

Zhao S., Lin Q., Ran J., Musa S.S., Yang G., Wang W. Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (2019-nCoV) in China, from 2019 to 2020: A data-driven analysis in the early phase of the outbreak. Int J Infect Dis. 2020; 92:214–217. doi: 10.1016/j.ijid.2020.01.050.

Ruiz A, Jiménez M. SARS-CoV-2 y pandemia de síndrome respiratorio agudo (COVID-19). Ars Pharm [Internet]. 2020 Jun [citado 2022 nov 28]; 61(2): 63-79. Disponible en: https://dx.doi.org/10.30827/ars.v61i2.15177.

Chen Y, Wang A, Yi B, Ding K, Wang H, Wang J, et al. Epidemiological characteristics of infection in COVID-19 close contacts in Ningbo city. Chin J Epidemiology [Internet]. 2020 [citado 2021 Dec 4]; 41(5): 667-71. Disponible en: doi: 10.3760/cma.j.cn112338-20200304-00251

Comincini E, Wilches JH, Saraví D. Factores epidemiológicos Ro y Re durante la COVID-19: ¿qué son y en qué difieren?. Revista Cuidarte [Internet]. 2021 [citado 2021 Dec 4]; 12(1):e1393. Disponible en: http://dx.doi.org/10.15649/cuidarte.1393

Peláez O, Más P. Brotes, epidemias, eventos y otros términos epidemiológicos de uso cotidiano. Rev Cubana Salud Pública [Internet]. Octubre 2020 [citado 2021 Dec 4]; 46(2). Disponible en: https://www.scielosp.org/article/rcsp/2020.v46n2/e2358/es/

Isaza P. Glosario de Epidemiología. Academia Nacional de Medicina de Colombia [Internet]. 2015 [citado 20 sept 2022]; 12p. Disponible en: http://www.academiamedicinatolima.org/uploads/7/1/5/9/71599273/glosario_epidemiologia_pdf.

Protocolo de investigación de brote epidémico https://www.juntadeandalucia.es/export/drupaljda/salud_5af95879cbfd0_protocolo_brote_epidemico.pdf

OPS/OMS. Módulos de principios de epidemiología para el control de enfermedades (MOPECE). Segunda Edición Revisada. Investigación epidemiológica de campo: aplicación al estudio de brotes [Internet]. https://www.paho.org/col/dmdocuments/MOPECE5.pdf

MINSAP. República de Cuba. Protocolo de actuación nacional para la covid-19. Documento técnico, Versión 1.6 [Internet]. La Habana, enero 2021 [citado 7 de abril de 2022]. Disponible en: https://files.sld.cu/editorhome/files/2020/08/VERSION-5-DEL-PROTOCOLO-PARA-PUBLICAR-13-DE-AGOSTO-2020.pdf

Distribución de la población vulnerable a la enfermedad COVID-19 en La Habana, Cuba. Rev Cubana de Hig y Epidemiol [Internet]. 2020 [citado 29 de nov de 2022]; 57:e371. Disponible en: https://www.medigraphic.com/pdfs/revcubhigepi/chi-2020/chi201f.pdf

Guzmán MG, Pérez L, Tejero Y, Mederos Y, Aguado ME, Pintos Y, et al. Emergence and evolution of SARS-CoV-2 genetic variants during the Cuban epidemic. J Clin Virol Plus [Internet]. 2022 [cited April 7, 2022]; 2(4):100104. Available in: https://doi.org/10.1016/j.jcvp.2022.100104

Fernández HM. SIG-ESAC: Sistema de Información Geográfica para la gestión de la estadística de salud de Cuba. Rev Cubana Hig Epidemiol [Internet]. 2006 Dic [citado 2023 Feb 07]; 44(3). Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1561-30032006000300003&lng=es.

Santovenia DJ, Tarragó MC, Cañedo AR. Geographical information systems for information management. Revista Cubana de Información en Ciencias de la Salud (ACIMED) [Internet]. 2009 [citado 2023 Feb 07]; 20(5):72-75. Disponible en: https://www.medigraphic.com/cgi-bin/new/resumenI.cgi?IDARTICULO=31215

Lloyd JO, Schreiber SJ, Kopp PE, Getz WM. Superspreading and the effect of individual variation on disease emergence. Nature [Internet]. 2005 [citado 29 de nov de 2022]; 438(7066):355-359. Disponible en: https://doi.org/10.1038/nature04153

Beneteau T, Elie B, Sofonea MT, Alizon S. Estimating dates of origin and end of COVID-19 epidemics. Peer Community Journal [Internet]. 2021 [citado 2023 Feb 07]; 1(70). Disponible en: https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.63

Adopción de medidas de nivel III por brotes comunitarios COVID-19 en Villanueva de los Infantes Disponible en: https://laadministracionaldia.inap.es/noticia.asp?id=1204380

Ministerio de sanidad. Gobierno de España. Plan de respuesta temprana en un escenario de control de la pandemia por COVID-19. Documento técnico, Jul 2020.

Minsap. Coronavirus en Cuba. Parte de cierre del día 30 de octubre a las 12 de la noche. La Habana: Minsap; 2021 [acceso 05/12/2022]. Disponible en: https://salud.msp.gob.cu/parte-de-cierre-del-dia-31-de-octubre-a-las-12-de-la-noche-2/

Portal JA. Intervención sanitaria con candidatos vacunales, como estrategia temporal de enfrentamiento a la COVID-19, Cuba, 2021. Rev Cubana Salud Pública [Internet]. 2022 Mar [citado 2023 Feb 07]; 48(1): e3513. Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0864-34662022000100002&lng=es.

Molina N, Morejón Y, Álvarez L, Cruz E, Baldoquín W. Transmisión intrahospitalaria de SARS-CoV-2. Revista Cubana de Higiene y Epidemiología [Internet]. 2022 [citado 3 Feb 2023]; 59. Disponible en: http://www.revepidemiologia.sld.cu/index.php/hie/article/view/1226

Pampa-Espinoza Luis, Loayza-Alarico Manuel, Meza-Cornejo Kely Rocio. Brote de COVID-19 en un albergue del perú. Rev. perú. med. exp. salud publica [Internet]. 2020 Jul [citado 2023 Feb 06]; 37(3): 585-586. Disponible en: http://dx.doi.org/10.17843/rpmesp.2020.373.5691

La contribución de los SIG al estudio de las epidemias [Internet]. 2020 Abr [citado 2023 Feb 08]. Disponible en: https://www.cursosgis.com/la-contribucion-de-los-sig-al-estudio-de-las-epidemias/

Colorado COVID-19. Outbreak maps [Internet]. 2023 Jan [citado 2023 Feb 08] Disponible en: https://covid19.colorado.gov/covid19-outbreak-data

Shim, E., Mizumoto, K., Choi, W., Chowell, G., 2020. Estimating the risk of COVID-19 death during the course of the outbreak in Korea, February-1 March, 2020. Case fatality of COVID-19 in Korea 3. Journal of Clinical Medicine 9, 1641. https://doi.org/10.1101/2020.03.30.20048264

Hernández Y, Ginori M, Pérez D, Fonte L. COVID-19. Una aproximación a temas de edad, sexo y género. Cubarte [Internet]. 2020 Julio 06 [citado 2023 Feb 08]. Disponible en: http://cubarte.cult.cu/revista-temas/covid-19-edad-sexo-y-genero/

Molina MC, Vázquez M. Diferenciales sociodemográficos de la COVID-19 en la juventud cubana. Rev Nov Pob [Internet]. 2021 Abr [citado 2023 Feb 08]; 17(33).

Guerra D, Olivares Y, López I. Brote de COVID- 19 en una institución hospitalaria. Revista Cubana de Higiene y Epidemiología. 2022;59:e1203.

Nishiura H, Kobayashi T, Miyama T, Suzuki A, Jung SM, Hayashi K, et al. Estimation of the asymptomatic ratio of novel coronavirus infections (COVID-19). Int J Infect Dis [Internet]. 2020 Abr [citado 2023 Feb 08]; 94:154-5. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/j.ijid.2020.03.020.

Betancourt J, Vázquez R, Acao L. Determinación de patrones de contactos para enfermedades de transmisión aérea en comunidades de Camagüey, Cuba. Revista Cubana de Higiene y Epidemiología. 2011; 49(1):4-14

Furukawa NW, Brooks JT, Sobel J. Evidence Supporting Transmission of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 While Presymptomatic or Asymptomatic. Emerg Infect Dis [Internet]. 2020 Jul [citado 2023 Feb 10]; 26(7): e201595. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7323549/ doi: 10.3201/eid2607.201595

Martínez A, Rodríguez J. Asintomáticos COVID-19 excluidos de protocolo. Atención Primaria [Internet] 2020 [citado 2023 Feb 10]. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.aprim.2020.06.005

Almadhi MA, Abdulrahman A, Sharaf SA, AlSaad D, Stevenson N, Atkin SL, et al. The high prevalence of asymptomatic SARS-CoV-2 infection reveals the silent spread of COVID-19. Int J Infect Dis [Internet] 2021 [citado 2023 Feb 10]; 105:656-661. Disponible en: doi: 10.1016/j.ijid.2021.02.100

Endo A, Abbott S, Kucharski AJ, Funk S. Estimating the over dispersion in COVID-19 transmission using outbreak sizes outside China Welcome Open Research [Internet] 2020 [citado 2023 Feb 10]; 5:67 Disponible en: https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.15842.3

Published

2023-08-03

How to Cite

1.
Cruz Rodríguez E, Galindo Santana BM, Baldoquín Rodríguez W, Molina Águila N, Rodríguez Velázquez D. COVID-19 outbreak of community transmission in a municipality in Havana (March-April, 2021). Rev. cuba. hig. epidemiol. [Internet]. 2023 Aug. 3 [cited 2025 Jan. 21];60. Available from: https://revepidemiologia.sld.cu/index.php/hie/article/view/1419

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