Bayesian structural time series model. An approach to VA-MENGOC-BC® impact assessment
Keywords:
impact assessment, Bayesian structural time series model, VA-MENGOC-BC®.Abstract
Introduction: A new public health intervention, such as the introduction of a vaccine, implies monitoring the indicators that guarantee its effectiveness, and the possibility of quantifying its benefits. Obtaining accurate estimates of the impact of a health intervention is considered a major challenge.
Objective: To estimate the causal impact of one of the leading products of the Finlay Institute in Havana: the registered and marketed Cuban vaccine VA-MENGOC-BC®.
Methods: Data from the health statistics yearbooks from 2009 to 2017 were selected. The incidence rate of the meningococcal disease in Cuba per 100 000 population and a set of co-variables that were not affected by the intervention, such as incidence rate of typhoid fever, tuberculosis, and fatality cases due to infectious diseases (parasitic or intestinal) per 100 000 population were used as variables of interest. The intervention year was 1989. The Bayesian structural time series model was applied to evaluate the causal impact of the continued vaccination with VA-MENGOC-BC® from 1989 to date.
Results: A significant cumulative causal impact in reducing the incidence of meningococcal disease was estimated. A decrease of 97.2% in the disease was verified.
Conclusions: The application of the Bayesian structural time series model to estimate the impact of the vaccine VA-MENGOC-BC® was a novel tool to estimate the counterfactual. It was provided an estimate of the impact of the vaccination with VA-MENGOC-BC®, an implemented and globally well-known vaccine.
Downloads
References
Angela Gentile JB, Laura Bialorus, Laura Caruso. Impacto de la vacuna neumocócica conjugada 13-vañente en la incidencia de neumonia en niños menores de 5 años en el partido de Pilar Bueno Aires: estudio de base poblacional. Arch Argent Pediatr [Internet]. 2015 [acceso 18/12/2021 ]; 113(6):502-9. 2015. Disponible en: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-00752015000600009
Rubin DB. Formal mode of statistical inference for causal effects. Journal of statistical planning and inference. 1990;25(3):279-92.
Linares-Pérez N, Toledo-Romaní M, Valdés-Balbín Y. La vigilancia y la evaluación de impacto como estrategias de salud pública: aportes para la introducción de la nueva vacuna cubana contra Streptococcus pneumoniae. Vacunas. 2018;19(2):44-51. Vacunas [Internet]. 2018 [acceso 18/12/2021];19(2):44-51.Disponible en: https://www.elsevier.es/es-revista-vacunas-72-avance-resumen-la-vigilancia-evaluacion-impacto-como-S1576988718300013
Gentile A BJ, Firpo V, Casanueva EV. PCV13 vacination impact: A multicenter study of pneumonia in 10 pediatrics hospital in Argentina. Ray Borrow, Public Helth -England, Unite Kingdom. 2018, A multicenter study of pneumonia in 10 pediatrics hospital in Argentina. PLoS One [Internet]. 2018 [acceso 18/12/2021]; 13(7): e0199989.Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6051625/
Jaume Blasco DC. Guía práctica 5 de Evaluación de impacto 2010. [acceso 18/12/2021]. 56p. Disponible en: https://fdocuments.ec/document/guia-practica-5-evaluacion-de-impacto.html?page=1
Brockwell PJyD, R. A. Introduction to Time Serie and Forecasting: [Internet]. 2 nd. ed. New York: Springer; 2002 [acceso 18/12/2021]. 449p. Disponible en: http://home.iitj.ac.in/~parmod/document/introduction%20time%20series.pdf
Wing C, Simon K, Bello-Gomez RA. Designing difference in difference studies: best practices for public health policy research. Annu Rev Public Health [Internet]. 2018 [acceso 20/12/2021];39: 453-69. Disponible en: https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-publhealth-040617-013507
Abadie A. Semiparametric difference-in-differences estimators. The Review of Economic Studies. Rev Econ Stud [Internet]. 2005 [acceso 20/12/2021];72(1):1-19. Disponible en: https://academic.oup.com/restud/article-abstract/72/1/1/1581053?redirectedFrom=fulltext
Donald SG, Lang K. Inference with difference-in-differences and other panel data. Rev Econ Stat [Internet]. 2007 [acceso 20/12/2021];89(2):221-33. Disponible en: https://direct.mit.edu/rest/article-abstract/89/2/221/57678/Inference-with-Difference-in-Differences-and-Other?redirectedFrom=fulltext
Gertler PJ, Martínez, Sebastián, Premand, Patrick, Rawlings, Laura B. La evaluación de impacto en la práctica: [Internet]. 2nd ed. Grupo Banco Mundial; 2016 [acceso 20/12/2021]; 404p. Disponible en: https://publications.iadb.org/es/la-evaluacion-de-impacto-en-la-practica-segunda-edicion
Pomaranz D. Métodos de Evaluación. [Internet].Boston: Harvard Business School; 2011 [acceso 20/12/2021]. 12p. Disponible en: https://www.hbs.edu/ris/Supplemental%20Files/Metodos-de-Evaluacion-de-Impacto_50067.pdf
Abadie A, Diamond A, Hainmueller J. Synthetic control methods for comparative case studies: Estimating the effect of California’s tobacco control program. J Am Stat Assoc [Internet]. 2010 [acceso 20/12/2021]; 105(490):493-505. Disponible en: https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1198/jasa.2009.ap08746
Abadie A, Diamond A, Hainmueller J. Comparative politics and the synthetic control method. Am J Pol Sci [Internet]. 2015 [acceso 20/12/2021]; 59(2):495-510. Disponible en: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ajps.12116
Abadie A, Gardeazabal J. The economic costs of conflict: A case study of the Basque Country. A case study of the Basque Country. Am Econ Rev [Internet]. 2003 [acceso 20/12/2021]; 93(1):113-32.Disponible en: https://www.aeaweb.org/articles?id=10.1257/000282803321455188
Amjad M, Shah D, Shen D. Robust synthetic control. J Mach Learn Res [Internet]. 2018 [acceso 20/12/2021]; 19(1):802-52.Disponible en: https://jmlr.org/papers/v19/17-777.html
Costa Dias M. The synthetic control method compared to difference in differences: discussion. 2014. Presentado en conferencia; 2014; Londres. Disponible en: https://eprints.ncrm.ac.uk/id/eprint/3339/
Firpo S, Possebom V. Synthetic control estimator: A generalized inference procedure and confidence sets. J. Causal Inference [Internet]. 2018 [acceso 23/12/2021]; 6(2). Disponible en: https://econpapers.repec.org/article/bpjcausin/v_3a6_3ay_3a2018_3ai_3a2_3ap_3a26_3an_3a1.htm
Possebom V. Free trade zone of Manaus: An impact evaluation using the synthetic control method. Rev. Bras. Econ [Internet]. 2017 [acceso 23/12/2021]; 71 (2): 71(2): 217-31. Disponible en: https://www.scielo.br/j/rbe/a/BjtvDXjCkLGFWYDpLqM3h7b/?lang=en
Brodersen KH, Gallusser F, Koehler J, Remy N, Scott SL. Inferring causal impact using Bayesian structural time-series models. Ann of Appl Stat [Internet]. 2015 [acceso 23/12/2021];9(1):247-74. Disponible en: https://arxiv.org/abs/1506.00356
Martin W, Sarro F, Harman M. Causal impact analysis for app releases in google play [Internet]. International Symposium on Foundations of Software Engineering; 2016 [acceso 23/12/2021]; 435p. Disponible ne: https://dl.acm.org/doi/10.1145/2950290.2950320
Aggarwal N. Inferring the causal impact of Super Bowl marketing campaigns using a Bayesian structural time series model: [tesis de maestría en Internet]. Nueva York: The Cooper Union Albert Nerken School of Engineering; 2017 [acceso 23/12/2021]; 58p. Disponible en: https://ee.cooper.edu/~keene/assets/Neema_Thesis_vFinal.pdf
Bruhn CA, Hetterich, Stephen, Schuck-Paim, Cynthia, Kürüm, Esra Taylor. Estimating the population-level impact of vaccines using synthetic controls. Proc Natl Acad Sci U S A [Internet]. 2017 [acceso 23/12/2021];114(7):1524-9. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28154145/
Kim S, Lee C, Gupta S. Bayesian synthetic control methods. J Mark Res. 2020;57(5):831-52.
Mok Leon L. Metodología de Control Sintético. Aplicación a Cuba. Cuba: Investigación Económica; 2018: 24p.
Scott SL, Varian HR. Predicting the present with bayesian structural time series. International Int. J. Math. Model. Numer. Optim [Internet]. 2014 [acceso 23/12/2021];5(1-2):4-23.Disponible en: https://research.google/pubs/pub41335/
Scott SL, Varian HR. Bayesian variable selection for nowcasting economic time series. Economic analysis of the digital economy: [Internet] En: Goldfarb A, Greenstein SM, Tucker CE, editores. Economic analysis of the digital economy. Chicago: University of Chicago Press; 2015 [acceso 23/12/2021]. 119-35p. Disponible en: https://www.nber.org/books-and-chapters/economic-analysis-digital-economy/bayesian-variable-selection-nowcasting-economic-time-series
Aldana AP, Álvarez JAG, Rodríguez LCD, Hermida MM, Basulto RR. Meningoencefalitis bacteriana en niños de Guantánamo. Su comportamiento durante 2007-2013. Su comportamiento durante 2007-2013. Rev Inf Cient [Internet]. 2018 [acceso 7/01/2022];97(1).Disponible en: http://www.revinfcientifica.sld.cu/index.php/ric/article/view/1822
Álvarez Fumero R, Manresa Gómez DL, Castro Pacheco BL, Pérez Orta M, Rojo Casares I, Quintana Jardines I. Manejo hospitalario de la meningoencefalitis bacteriana por S. Neumoniae. Rev cuba pediatr [Internet]. 2003 [acceso 7/01/2022]; 75(4): [cerca de 9 pantallas]. Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-75312003000400005
Dickinson Meneses FO, Pérez Rodríguez AE. Las meningoencefalitis bacterianas en la población infantil cubana: 1998-2000. Rev Cubana Pediatr [Internet]. 2002 [acceso 7/01/2022];74(2):106-14.Disponible
Linares-Pérez N. Introducción de la vacunación antineumocócica, un proyecto conjunto de la Biotecnología y el Sistema de Salud Cubano. Rev Cubana Pediatr [Internet]. 2017 [acceso 7/01/2022]; 89:1-3.Disponible en: http://www.revpediatria.sld.cu/index.php/ped/article/view/297/112
Sierra-González VG. Vacuna cubana antimeningocócica VA-MENGOC-BC®: Treinta años de uso y potencialidades vigentes. Vaccimonitor [Internet]. 2020 [acceso 7/01/22]; 29(1):32-43. Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1025-028X2020000100031
Ning B, Ghosal S, Thomas J. Bayesian method for causal inference in spatially-correlated multivariate time series. Bayesian Anal [Inerrnet]. 2019 [acceso 7/01/2022]; 14(1): 1-28. Disponible en: https://projecteuclid.org/journals/bayesian-analysis/volume-14/issue-1/Bayesian-Method-for-Causal-Inference-in-Spatially-Correlated-Multivariate-Time/10.1214/18-BA1102.full
Vacunas IFd. Instituto Finlay de Vacunas: IFV; 2019 [cited 2019 Agosto, 2019]. Available from: http//:www.finlay.edu.cu.
Sierra-González VG. Cuban meningococcal vaccine VA-MENGOC-BC: 30 years of use and future potential. MEDICC Rev [Internet]. 2019 [acceso 11/01/2022];21(4):19-27.Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32335565/
Ochoa Azze RF. VA-MENGOC-BC®: XXV años de su aplicación masiva. VacciMonitor [Internet]. 2013 [acceso 11/01/2022]; 22(1):1-3.Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1025-028X2013000100001
De Oliveira LH, Jauregui B. La Medición del Impacto y la Eficacia en la Introducción de Nuevas Vacunas en América Latina y el Caribe. Vacunología. 2018:195.
Abadie A. Using synthetic controls: Feasibility, data requirements, and methodological aspects. J Econ Lit [Internet]. 2021 [acceso 11/01/2022];59(2):391-425. Disponible en: https://www.aeaweb.org/articles?id=10.1257/jel.20191450
Abadie A, L’Hour J. A penalized synthetic control estimator for disaggregated data. [Internet]. Economics; 2018 [acceso 11/01/2022]. 45p. Disponible en: https://arxiv.org/abs/1803.00096.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
La Revista Cubana de Higiene y Epidemiologia protege los derechos de autor, y opera con una Licencia Creative Commons 4.0.(Licencia Creative Commons Atribución-No Comercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0).Al publicar en ella los autores permiten copiar y redistribuir el material en cualquier medio o formato; remezclar, transformar y crear a partir del material. Debe reconocer adecuadamente la autoría, proporcionar un enlace a la licencia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ e indicar si se han realizado cambios. No puede utilizar el material para una finalidad comercial. No hay restricciones adicionales.
Los autores autorizan la publicación de sus escritos conservando los derechos de autoría, y cediendo y transfiriendo a la revista todos los derechos protegidos por las leyes de propiedad intelectual que rigen en Cuba, que implican la edición para difundir la obra.
Los autores podrán establecer acuerdos adicionales para la distribución no exclusiva de la versión de la obra publicada en la revista (por ejemplo, situarla en un repositorio institucional o publicarla en un libro), con el reconocimiento de haber sido publicada primero en esta revista.